不同品種的貓眼睛顏色都不同，其實貓眼睛的顏色并不多,一般都是藍色、黃色、綠色、淺棕色、琥珀色、紫鋼色這幾種而已，另外還有些顏色深淺的差異。
貓眼睛顏色不同的原因是出于品種的不同，或同一品種中個體的貓對色素的吸收和儲存的能力不一樣。不同顏色的色素沉積在各種貓的眼底視網膜上，使它們視網膜上顏色各異。我們所看到的貓眼睛的顏色，其實就是透過透明的角膜看到的貓眼底視網膜上的顏色。色素在視網膜與在皮膚毛囊內的沉積有一定相關性。因此貓眼睛的顏色與貓背毛的顏色之間有一定聯系。比如花貓絕沒有藍眼睛，黑貓眼睛以綠色為多，而長毛白貓則以藍色居多，有時有些雙眼顏色不同的鴛鴦眼。貓眼的顏色對于貓本身的實際作用尚未可知。但人們在評價貓眼睛的顏色時，一般都以越清澈透明，顏色越純、越深、越有寶石感的為佳。
另外，貓的眼睛顏色還是鑒定純種貓的重要依據之一。一些純種貓的眼睛顏色是固定的某種顏色，如純種暹羅貓、純種喜馬拉雅貓的眼睛必然是藍色的。如果一只貓整體外型和某種純種貓一樣，但眼睛顏色不符合該純種貓的眼睛顏色，就說明這只貓不是純種的，已經混有其它品種的血統了。

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