在母藏獒出現發情征兆后，就要著手選擇一條優良的公獒作其配偶，公獒的品質將直接關系到下一代獒仔的優劣，要選擇無退化現象，神經類型穩定，體質健壯，生長發育快抗病力和繁殖能力都強的公獒。　配種的佳時機應在母獒陰部流血后的12-13天間。這時母獒開始排卵，生殖道已為交配做好了準備，母獒也表現出愿意交配的征兆，如陰門充分腫脹甚至外翻，陰道分泌物的量減少并且由開始時的血樣粘液逐漸變成淺色或不見血，如用手按壓母獒腰部或扶按尾部，則站立不動，尾巴抬起偏向一側，陰門頻頻開閉。遇公獒則頻頻排尿，表示愿意接近公獒，讓公獒嗅其陰部，接受公獒爬跨，有是還爬跨公獒，表現越來越強的性欲。見上面這些征兆后，要盡快讓其交配。一定要在母獒交配欲強，發情征兆明顯時交配。　配種次數以兩次為好，即初配和復配。兩次相隔距離的時間以24-48小時為宜，以免影響受精卵的發育。交配的地點好是在母獒生活的地方，不要多人圍觀，以免在交配過程中收到驚嚇，影響交配。交配時以自然方法為主，輔以人工幫助方法。交配時，當陰莖插入陰道后幾秒鐘開始射精，隨后海綿體充分膨脹成栓塞狀。這時母獒會扭動身體，試圖將公獒從背上摔下，或公獒自動下來，公母獒成對尾姿勢。這種栓塞狀態持續10-25分鐘，有時時間更長，這時公獒的陰莖會在母獒陰道內旋轉180度，再次射精，因此這時不可強行分開，否則會嚴重損傷生殖器官。 當公母獒松脫后，會各自舔陰部，不可馬上牽拉，驅趕，尤其是公獒，在交配后常會出現腰部凹陷，俗稱“掉腰子”切不可讓其劇烈運動。交配后也不可讓其馬上飲水，應休息片刻，活動一會再讓其飲水。交配時間，夏季好在清晨或傍晚，冬季則以中午交配唯宜。交配前好不要喂食或不要喂得過飽，以免因食后立即交配而引起嘔吐。

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